重金屬污染。采礦、冶金和化工等工業排放的三廢、汽車尾氣以及農藥和化肥的使用都是土壤重金屬的重要來源。按生物化學性質，土壤中的重金屬可以分為兩類：第一類，對作物以及人體有害的元素，如汞、鎘、鉛及類金屬砷等，因此，必須減少這些元素的含量，使其不超過環境的容量；第二類，常量下對作物和人體有益而過量時出現危險的元素，如銅、鋅、鉻、錳及類金屬硒等，應控制其含量，使其有益作物生長和人體健康。

石油污染。石油污染是指在石油的開采、煉制、貯運、使用過程中，原油和各種石油制品進入環境而造成的污染，土壤中的石油污染物多集中在20cm左右的表層。石油開采過程中產生的落地油和油田的接轉站、聯合站的油罐、沉降罐、污水罐、隔油池的底泥，煉油廠含油污水處理設施產生的油泥，也是我國油田土壤石油污染的主要來源。污染修復土壤中石油主要成分為C15-C36的烷烴、多環芳香烴、烯烴、苯系物、酚類等，其中環境優先控制污染物多達30種。

化肥污染。化學肥料在現代化的農業生產中不僅是糧食增產的物質基礎，更是農業生產資料的主體。在糧食增產中花費的貢獻率在40%-60%，穩定在50%左右，但是化肥中的有毒重金屬、有機物以及無機酸類等是造成土壤污染的主要來源。

農藥污染。據初步統計，我國至少有l300-1600萬hm2耕地受到農藥污染。造成土壤農藥污染的主要是有機磷和有機氯農藥。據2000年國家質檢總局數據，全國47.5%的蔬菜農藥殘留超標，因農殘超標被退回的出口農產品金額達74億美元。