微生物修復技術是指利用微生物，將存在于土壤、地下水以及海洋環境中的有毒有害的污染物質降解或者轉化成無害物質，從而使污染的生態環境修復為正常生態環境的工程技術。

微生物修復技術主要有土著微生物培養法以及接種微生物法。根據工程實施的方法又分為原位修復技術和異位修復技術。原位修復技術是主要依賴于土著微生物的降解能力對污染水體進行處理。異位修復技術是通過投加外源的微生物進行污水治理。

（1）土著微生物培養法

此方法是通過向水體中投加營養物質、促生液、電子受體或增加水體中的溶解氧激活水體環境中本身就具有降解污染能力的土著微生物，充分發揮土著微生物對污染物的降解能力，從而達到水體修復的目的。

（2）接種微生物法

這種技術是通過向污染水體中投加菌種來實現凈化水體的效果。引入菌種主要來源有：①從污染水體中富集的土著微生物；②從其他自然生態環境中分離的微生物；③基因工程菌。

     微生物修復技術的主要優點包括修復周期短、具有長效性、易于操作、無二次污染、對周邊環境影響小等。